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上海市肺科医院肿瘤科为该院重点科室，同济大学及苏州大学医学院医学硕士、博士*培养点，是较早开展肺癌多学科综合治疗、个体化治疗的单位之一，肺癌治疗有效率、长期生存率达国内先进水平。肿瘤科共四个病区，住院床位184张，年收治病人7000例次，常规开展经纤维支气管镜刷检、（肺）活检、穿刺、灌洗，经皮肺穿刺/活检、胸膜活检、癌基因与肿瘤标志物等检测，结合胸部CT、同位素扫描等检查手段，疾病诊断迅速，符合率高。患者平均住院天数仅6天。此外，肿瘤科还设有肺癌免疫研究室，拥有先进完备的硬件设施和分子生物学研究技术，主要从事肺癌相关的基础研究。