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中山医院消化科由著名内科学家林兆耆教授于1953年创立，1978年正式建科，朱无难教授任首任主任；1983－1999年，刘厚钰教授任主任；1999－2009年，王吉耀教授任主任。2009年至今，沈锡中教授任主任。中山医院消化科是卫生部专科医师培训基地、国家药品监督管理局中山医院临床药理基地单位、内科博士点和博士后流动站，2010年获卫生部首批临床重点专科建设项目。 目前中山医院消化科设有两个独立的病区，共有核定床位106张，2014年出院人数达5400人次。住院病人多为来自全国各地的疑难重危病人。专科门诊每周6天，由副教授和主治医师轮流坐诊；每周6天均开设专家门诊。2014年门诊人数已逾23万人次，其中专家门诊逾8万。同时设有慢性肝病、內镜治疗、肠道疾病、胃食管反流等专病及特色门诊。承担多项国家自然科学基金研究课题、上海市科委和863课题。研究成果“肝纤维化细胞分子机制与治疗策略”获上海医学科技一等奖及中华医学科技三等奖（第一完成单位）（2008）、“消化道肿瘤及慢性肝病靶向纳米药物载体研制”获上海科技进步二等奖及教育部科技进步二等奖（第一完成单位）（2007）。经过数十年的发展和积累，复旦大学附属中山医院消化科形成了一支掌握消化科诊疗核心技术的强大的学术队伍。目前消化科共有医师30名（不包括在大内科进行规范化培训的住院医师），包括正高7名、副高10名、主治医师11名、完成规范化培训的住院医师2名。其中获博士学位20人，硕士学位9人，学士学位1人。本学科十分重视人才培养和学科建设，鼓励年轻医护人员出国进修或在职攻读学位。主要青年主治医师大都曾出国进修，赴美国、德国、瑞典、法国、香港等地学习肝病、内镜治疗、腹腔镜等科研和临床技能，学成回国后均能独立开展相应的科研和临床新技术应用工作。目前已形成一支包括4名博士研究生导师在内的老中青结合，以中青年为主，梯次合理的，在医、教、研各方面均有一定能力的不同层次的稳定的人才队伍。在慢性肝病和肝硬化并发症的临床和基础研究方面，复旦大学附属中山医院经数十年的积累，已形成了有别于国内其他兄弟单位、独特的优势和明确的发展方向。具体表现在：1）开展以肝穿刺病理活检为特色的肝病诊治：肝穿刺病理活检是诊断肝病的金标准，复旦大学附属中山医院消化科自从上世纪60年代在华东地区开展首例肝穿刺病例以来，共进行肝穿刺近4000例，技术精湛。中山医院消化科结合了复旦大学上海医学院病理教研室的优势，开展每月一次病例讨论会，结合病理切片特征，特邀复旦大学上海医学院病理科资深教授，定期读片，密切基础和临床的关系，解决了多种疑难病例的诊断问题，同时促进了学科共同发展和解决疑难问题的整体实力。新开展的慢性肝病诊断项目如血清肝纤维化指标、肝纤维化无创检查方法探索、慢性乙型肝炎抗病毒治疗个体化选择等以肝穿刺活检为参照，大大提高了临床诊疗水平和医疗质量。2）肝病和肝硬化并发症的诊治具有一定的影响力：复旦大学附属中山医院消化科年门诊达到23万人次，其中肝病相关病人约占40%。为了更好的发挥肝病诊疗特色，消化科特设了慢性肝病等各个专病门诊，由专门对应的主治医生负责，对病人的诊治精益求精。并且开展了各类病人的随访工作，和标准化生物样本采集保存工作。在慢性肝病和肝硬化并发症的治疗上开展腹水浓缩回输术治疗顽固性腹水等技术。3）食管胃底静脉曲张破裂出血预防与治疗，复旦大学附属中山医院能开展经颈静脉肝内门－体分流、经门脉胃冠状－胃静脉栓塞等技术。根据不同患者的具体病情设计严格的药物治疗，内镜下治疗（套扎术、硬化剂注射术、组织粘合剂注射术）和放射介入下治疗的综合治疗措施。2014年起，开展肝硬化门脉高压食管胃静脉曲张破裂出血多学科协作综合（MDT）。通过消化科、肝外科、介入科、普外科、放射科、超声科、病理科等多学科进行综合讨论后，给患者提供全方面的评估，规范的、个体化的预防再出血治疗方案，体现案例循证处理与个体化处理相结合。4）肝纤维化形成机制的基础研究和综合防治肝纤维化是多种慢性肝病向肝硬化发展的必经中间环节，是肝硬化的初始和可逆阶段。阻断和逆转肝纤维化进展是防止肝病进展到肝硬化阶段的关键。我科年收住肝硬化及其并发症患者400多例，其中80％以上是以肝性脑病、食管胃底曲张静脉破裂出血、原发性细菌性腹膜炎、顽固性腹水等肝硬化严重并发症入院。医疗特色－肝癌的非手术综合治疗肝癌临床综合治疗：在循证医学理论指导下，和外科合作，积极开展患者术前综合评估、分期和术后随访；规范新辅助化疗、术后化疗方案；对不能手术切除和术后复发的患者，与兄弟科室一起积极开展综合治疗，包括放疗、热疗、介入治疗和生物治疗等。医疗特色—胰腺及肠道疾病的诊疗本科采用中西医方法联合治疗模式治疗急性胰腺炎重症病人，大大提高了抢救的成功率。同时我们拥有内镜下诊断治疗胆胰疾病的能力。并与本院的外科胰腺学组合作，共同制定药物、手术、内镜治疗胰腺癌的联合方案，提高胰腺癌患者的总生存率及生活质量。炎症性肠病方面，我们开设肠病专病门诊，紧跟国际前沿，规范化，个体化治疗各疾病期溃疡性结肠炎、克罗恩病患者。医疗特色－内窥镜诊治早在上世纪60年代，消化科李宗明教授和朱无难教授应用旧德国产半曲式胃镜进行了胃镜检查；70年代引进纤维、80年代引进电子后，中山医院内镜中心获得了飞速发展。目前内镜中心规模齐全，设施先进，2012年胃镜检查49000人次，肠镜诊疗超过30000人次，ERCP1200人次，超声内镜3500人次。除积极开展常规内镜诊疗技术外，内镜中心还积极开展各项新技术：2006年开展内镜粘膜下剥离术，2012年完成近2000例治疗。2010年获上海市医学科技奖一等奖。2010年率先在中国内开展经口内镜下切开术，用于治疗贲门失弛缓症，病人恢复快，避免了开胸的痛苦。